Pedro Soares de Sousa, filho de João Soares de Sousa, 2º capitão-do-donatário de Santa Maria e de Guiomar da Cunha. Criado na Corte, considerado como um homem de caráter e muito caridoso, como o pai. Desposou na Ilha da Madeira, Beatriz de Morais, filha de João de Morais e de Catarina Fernandes. Seu filho, Brás Soares de Sousa (c. 1570 - Pernambuco, Brasil, 1634), que desposou Doroteia de Melo, sucedeu-lhe no governo da ilha como 4º capitão-do-donatário.
Foi pai de João Soares de Sousa (c. 1560 -?), que foi frade de Ordem de São Jerónimo; António Soares, que embarcou para a Índia; Henrique de Sousa, que veio a falecer; Brás Soares de Sousa (c. 1570 - 1634), 4º capitão-do-donatário de Santa Maria; e Ana de São João, que foi freira professa no Convento de N. Sra. da Esperança, em Ponta Delgada.
Enquanto solteiro teve uma filha natural, de nome Concórdia de Sousa, que também foi religiosa, com o nome de Concórdia dos Anjos.